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Conselho Diretivo
- Presidente - José Apolinário
- Vice-Presidente - José Pacheco
- Vice-Presidente - Elsa Cordeiro
- Vice-Presidente - Pedro Valadas Monteiro
Unidades Operacionais
- Unidade de Planeamento e Desenvolvimento Regional (UPDR)
Diretora de Unidade: Maria de Lurdes Carvalho
- Divisão de Planeamento Estratégico e Desenvolvimento Regional (DPEDR)
Chefe de Divisão: Elisabete Lemos
- Divisão de Cooperação Externa e Transfronteiriça (DCET)
- Chefe de Divisão: Maria Catarina Cruz
- Unidade de Ambiente, Conservação da Natureza e Biodiversidade (UACNB)
Diretora de Unidade: Maria José Nunes
- Divisão de Avaliação Ambiental e Biodiversidade (DAAB)
Chefe de Divisão: Ricardo Canas
- Unidade de Ordenamento do Território (UOT)
Diretor de Unidade: Jorge Eusébio
- Divisão de Sustentabilidade do Território e Valorização da Paisagem (DSTVP)
Chefe de Divisão: Henrique Cabeleira
- Divisão de Ordenamento do Território e Urbanismo (DOTU)
Chefe de Divisão: Manuel Vieira
- Divisão de Cadastro e Sistema de Informação Geográfica (DCSIG)
Chefe de Divisão: Vitor Leal
- Unidade de Cultura (UC)
Diretor de Unidade: Frederico Tátá Regala
- Divisão de Ação Cultural (DAC)
Chefe de Divisão: Elsa Cavaco
- Unidade de Investimento e Inovação na Agricultura e Pescas (UIIAP)
Diretor de Unidade: Miguel Estevão
- Divisão de Incentivos (DI)
Chefe de Divisão: Helena Lopes
- Divisão de Economia do Mar e Pescas (DEMP)
Chefe de Divisão: Carla Gomes
- Divisão de Apoio à Produção Agrícola, Inovação e Formação (DAPAIF)
Chefe de Divisão: Celestino Soares
- Unidade Agroalimentar e Desenvolvimento Rural (UADR)
Diretor de Unidade: Rui Costa
- Divisão de Agroalimentar, Controlo e Estatística Agrícola (DACEA)
Chefe de Divisão: Juan Sousa
- Divisão de Licenciamentos e Desenvolvimento Rural (DLDR)
Chefe de Divisão: Carlos Ludovico
- Divisão de Apoio Técnico de Proximidade (DATP)
Chefe de Divisão: João Santana
- Unidade de Gestão Administrativa, Financeira, Recursos Humanos e de Fiscalização (UGAFRHF)
Diretora de Unidade: Ana Lúcia Guerreiro
- Divisão de Gestão Financeira (DGF)
Chefe de Divisão: Carla Neves
- Divisão de Recursos Humanos e Formação (DRHF)
Chefe de Divisão: Silvia Estevens
- Divisão de Gestão Administrativa, Patrimonial e de Contratação Pública (DGAPCP)
Chefe de Divisão: Élia Pedro
- Divisão de Sistemas e Tecnologias de Informação (DSTI)
Chefe de Divisão: Carlos Cardoso
- Divisão de Fiscalização
Chefe de Divisão: Maria Laura Mestre
- Unidade de Serviços Jurídicos e de Apoio à Administração Local (USJAAL)
Diretora de Unidade: Isabel Coelho
- Núcleo de Assuntos Jurídicos e Contraordenações (NAJC)
Chefe de Equipa: Maria Fernanda Oliveira
- Divisão de Informação e Relações-Públicas (DIRP)
Chefe de Divisão: José Graça
- Divisão de Auditoria e Controlo Interno (DACI)
Chefe de Divisão: Nélson Almeida
- Núcleo de Conferência de Serviços e Balcão Único (NCSBU)
Chefe de Equipa: Mário Dias
