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Conselho Diretivo
	- Presidente - José Apolinário
- Vice-Presidente - José Pacheco 
- Vice-Presidente - Elsa Cordeiro 
- Vice-Presidente - Pedro Valadas Monteiro
 
Unidades Operacionais
	- Unidade de Planeamento e Desenvolvimento Regional (UPDR)
 Diretora de Unidade: Maria de Lurdes Carvalho
		- Divisão de Planeamento Estratégico e Desenvolvimento Regional (DPEDR)
 Chefe de Divisão: Elisabete Lemos
- Núcleo de Apoio à Cooperação Externa e Transfronteiriça (NACET)
- Chefe de Equipa: Maria Catarina Cruz
 
 
- Unidade de Ambiente, Conservação da Natureza e Biodiversidade (UACNB)
 Diretora de Unidade: Maria José Nunes
		- Divisão de Avaliação Ambiental e Biodiversidade (DAAB)
 Chefe de Divisão: Ricardo Canas
 
 
- Unidade de Ordenamento do Território (UOT)
 Diretor de Unidade: Jorge Eusébio
		- Divisão de Sustentabilidade do Território e Valorização da Paisagem (DSTVP)
 Chefe de Divisão: Henrique Cabeleira
- Divisão de Ordenamento do Território e Urbanismo (DOTU)
 Chefe de Divisão: Manuel Vieira
- Divisão de Cadastro e Sistema de Informação Geográfica (DCSIG)
 Chefe de Divisão: Vitor Leal
 
 
- Unidade de Cultura (UC)
 Diretor de Unidade: Frederico Tátá Regala
		- Divisão de Ação Cultural (DAC)
 Chefe de Divisão: Elsa Cavaco
 
 
- Unidade de Investimento e Inovação na Agricultura e Pescas (UIIAP)
 Diretor de Unidade: Miguel Estevão
		- Divisão de Incentivos (DI)
 Chefe de Divisão: Helena Lopes
- Divisão de Economia do Mar e Pescas (DEMP)
 Chefe de Divisão: Carla Gomes
- Divisão de Apoio à Produção Agrícola, Inovação e Formação (DAPAIF)
 Chefe de Divisão: Celestino Soares
 
 
- Unidade Agroalimentar e Desenvolvimento Rural (UADR)
 Diretor de Unidade: Rui Costa
		- Divisão de Agroalimentar, Controlo e Estatística Agrícola (DACEA)
 Chefe de Divisão: Juan Sousa
- Divisão de Licenciamentos e Desenvolvimento Rural (DLDR)
 Chefe de Divisão: José Paulo Jesus
- Divisão de Apoio Técnico de Proximidade (DATP)
 Chefe de Divisão: João Santana
 
 
- Unidade de Gestão Administrativa, Financeira, Recursos Humanos e de Fiscalização (UGAFRHF)
 Diretora de Unidade: Ana Lúcia Guerreiro
		- Divisão de Gestão Financeira (DGF)
 Chefe de Divisão: Carla Neves
- Divisão de Recursos Humanos e Formação (DRHF)
 Chefe de Divisão: Silvia Estevens
- Divisão de Gestão Administrativa, Patrimonial e de Contratação Pública (DGAPCP)
 Chefe de Divisão: Élia Pedro
- Divisão de Sistemas e Tecnologias de Informação (DSTI)
 Chefe de Divisão: Carlos Cardoso
 
 
- Unidade de Serviços Jurídicos e de Apoio à Administração Local (USJAAL)
 Diretora de Unidade: Isabel Coelho
		- Divisão de Serviços Jurídicos e de Apoio à Administração Local (DSJAAL)
 Chefe de Divisão: Cidália Mendes
 
 
- Divisão de Informação e Relações-Públicas (DIRP)
 Chefe de Divisão: Ana Viegas
 
- Divisão de Auditoria e Controlo Interno (DACI)
 Chefe de Divisão: Nélson Almeida
 
- Divisão de Fiscalização (DF)
 Chefe de Divisão: Maria Laura Mestre
 
- Núcleo de Conferência de Serviços e Balcão Único (NCSBU)
 Chefe de Equipa: Mário Dias