A Lagoa dos Salgados está classificada como zona sensível de acordo com a Directiva das águas residuais urbanas, significando que, desde 1998, as descargas de águas residuais de aglomerados com mais de 10 000 habitantes equivalentes (h. e.) terão, obrigatoriamente, que ser sujeitas a um tratamento superior ao secundário (remoção de nutrientes e de carga bacteriológica).
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